苗栗機務分駐所為臺灣鐵路局的組織，隸屬於機務處新竹機務段，位於苗栗車站南側。苗栗機務分駐所的前身是「苗栗機務段」，在明治39（1906）年建於苗栗火車站右前方，昭和10（1935）年大地震毀損後才遷至現址苗栗機關庫，於昭和12（1937）年啟用，是蒸汽火車行駛時期確保山線行車平安的重要組織。

苗栗站向南即為隧道橋樑密集、坡陡彎度大的險峻山線，在上坡前必須確保蒸汽火車有充足的動力來源──煤炭與水，苗栗機務段的設立便是為此，場內有儲水塔、堆煤場、投煤場等設備，加上蒸汽機車保養、機車機班運用等業務，機務段全盛時期員工就將近300人。然而在民國67（1978）年鐵路電氣化後，蒸汽機車逐漸被電力機車淘汰，加煤、加水以及蒸汽機車的保養維修工作萎縮，苗栗機務所遂於民國69（1980）年降為「苗栗機務分段」，隔年再因機車保養工作轉移，而成為僅剩機車、機班運用功能的「苗栗機務分駐所」。