19世紀末至20世紀初，樟腦在全球市場帶來的巨大經濟效益，讓日本殖民政府領臺之初即積極展開對此產業之布局。先是設了專賣制與機構，驅逐清領時期臺灣腦業的外商勢力；繼而給了三井等日本財團來壟斷製腦業。苗栗舊山線所處的三叉河一帶，自清領時期亦是重要製腦地，日治時期因黃南球等墾首仍有地方仕紳權勢，難得的保留製腦權，在內草湖、魚藤坪、關刀山等地經營腦業，但全臺腦業至此幾乎已被殖民政府所控制。

明治29（1896年），臺灣總督府為有效接收製腦業的利潤，除了於苗栗、南庄、大湖、三叉河、魚藤坪、牛稠坑等地設置「撫墾局」，並在苗栗設置「製腦關係辦務署」，劃設「製腦地」確認樟腦開發範圍，再核發製腦許可證來掌握製腦者，從中獲取稅收利益。明治32（1899）年總督府設置樟腦局實施「樟腦專賣制度」，進一步控制樟腦市場；另一方面也將專賣事業委託民間資本代辦，使日本大財團得以滲透入臺灣腦業，因此到了明治43（1910）年左右，「三井物產」、「臺灣製腦合名會社」、「新竹製腦株式會社」等幾乎已獨佔苗栗以北的製腦權。大正8（1919）年「日本樟腦株式會社」更藉由再製、精製樟腦工廠的設置壟斷整個樟腦市場。直到二次大戰與人工樟腦出現，殖民後期的腦業管控才下降。