補庫是指燒庫寶、元寶金紙、供品以添補神明財庫的祭儀，而神境如人境，神明需要應酬驅除魔鬼，大約春夏之交舉行的補庫，也正是天氣變化，需要神明保佑不為瘴氣纏身的季節。

根據《馬祖文化事典》分析，馬祖列島由於受海岸地形影響，形成一村一澳口的聚落型態；海岸線示水路分隔之處，俗信也是陰陽交界的地帶，因而廟宇多建於海邊，廟神無形中兼具水神的職能，因此補庫醮祭包含「陸祭」和「海祭」兩場科儀，具備水陸法會的意涵，類似佛教中元普渡的意思，期望四方邪異在食用完祭品後，能得到撫慰，減少對村裡的作祟和侵擾。陸祭又稱「廟祭」，儀式從早開始迄於午後，村民擺設「碗筵」(供品)與庫寶金紙，供廟內神明享用。陸祭在鼓板樂敲擊聲中結束，再由保長公率主祀神旗隊伍，將供桌、香爐、令牌及書寫廟神名號的三角令旗移往岸邊供設，準備進行海祭。